来源:《分子植物育种》2019年第22期  作者:刘欣雨;魏宇昆;李桂彬;
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丹参转录组的微卫星位点(SSR)特征及属内通用引物的开发

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唇形科(Lamiaceae)鼠尾草属(Salvia)是一个具有丰富物种和高度多样性的类群,具有很高的科学研究与经济价值。该属可利用的通用SSR引物有限,因而从其代表物种丹参(Salvia miltiorrhiza)中开发新的通用性好的SSR引物十分必要。本研究利用丹参的15.99 Mb转录组数据,分析了含有Unigene的33 438条序列,共获得2 095个SSR候选位点,其包括了570个等位基因,每个位点的等位基因数范围在2~18个,平均每个位点7.92个。多态信息含量(PIC)范围在0.049至0.936之间,平均为0.707。根据设定条件选取了150个产物大小介于100~200 bp的引物,对属内20个物种进行通用性与多态性的检测,成功开发出通用性好,多态性丰富的72对引物。这些验证物种代表了鼠尾草属的3个不同亚属,可用于属内物种的遗传关系及其生态遗传学研究,具有较广泛的利用前景。(本文共计8页)......[继续阅读本文]

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