来源:《中国农业科学》2018年第06期  作者:周俊飞;崔野韩;唐浩;李论;陈红;温雯;韩瑞玺;黄思思;方治伟;彭海;
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利用概率估算提高植物品种分子标记鉴定的准确率

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【目的】植物品种分子标记鉴定标准只抽检了基因组上部分标记位点,存在抽样误差,鉴定结论常常因此被质疑。估计植物品种分子标记鉴定位点的抽样误差与鉴定结论的可靠性,为品种分子鉴定标准的应用提供科学依据。【方法】以2个品种间观察到的差异位点的数目为条件,根据贝叶斯公式建立品种间真实差异位点数目的条件概率模型。根据观察到的差异位点的数目服从于二项分布,且真实差异位点数的先验概率近似于均匀分布的特点,实现条件概率模型的计算。根据概率模型获得的概率保障的大小,将品种间的关系划分为红区、绿区和黄区,对应相同或近似品种、不同品种和待定品种。利用8个水稻品种的3 205个SSR分子标记位点的分型结果,估计2个品种组合间的真实差异水平,进而判定品种间关系的真实值。对每一对品种进行10 000次的分子标记位点的模拟抽样,每次抽取48个SSR标记位点。根据每次模拟抽样的结果,按概率模型计算概率并判定品种间的关系,将判定结论与真实值比较,验证概率模型的准确性。最后,利用概率模型为近期的西瓜品种侵权案的判决结论提供概率支持。【结果】在模拟抽样的验证试验中,每个品种组合有4 295—10 000次随机抽样在95%的概(本文共计7页)......[继续阅读本文]

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