来源:《癌变·畸变·突变》2020年第02期  作者:熊英友;杨丽;方呈祥;吴倩;张微;赵毅;文静;
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数据挖掘分析在食管癌中的表达及通过P53/ROS通路调节细胞铁死亡的意义

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目的:分析溶质运载蛋白7家族成员11(SLC7A11)在食管癌(ESCA)组织中的表达与功能,及对患者生存预后的影响。方法:基于Oncomine及GEPIA数据库,检索SLC7A11在ESCA组织与正常食管组织中的表达差异;采用GeneMANIA数据库构建有关SLC7A11的蛋白互作网络(PPI),并进行功能注释分析其共同富集的生物学功能;通过KEGG Pathway数据库分析其参与的信号通路;利用R2基因分析可视化平台,绘制Kaplan-Meier函数曲线,分析SLC7A11的表达对患者生存预后的影响。结果:Oncomine及GEPIA数据分析显示,SLC7A11在ESCA组织中mRNA的表达水平较正常组织显著升高(P<0.05),且高表达组患者生存预后较差,差异具有统计学意义(P<0.05);SLC7A11与SLC3A2、BSG、ASNS、PHGDH、TERT、CD44等20种蛋白相互作用,主要富集于氨基酸转运、修饰氨基酸的跨膜转运活性、白细胞游走、多肽抗原绑定等生物学功能;SLC7A11通过P53/ROS信号的活化介导细胞铁死亡信号通路(hsa04216)的调节。结论:SLC7A(本文共计6页)......[继续阅读本文]

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